身體許多部位也可能因為先天的缺陷或是外傷, 手術等因素而導致皮膚外觀的凹陷或不對稱, 因這類體表的凹陷多屬於深層且大面積的陷落, 很難用透明質酸注射等非手術方式來矯正, 且其效果也多非常得短暫, 故具有方便取用與大量回填等特性的自體脂肪, 即成為填補身體大面積凹陷的最經濟選擇. 此類手術的作法與自體脂肪豐胸注射類似, 皆須先將抽脂取得的脂肪細胞經過純化過濾與生長因子混合過程後, 再適量的注射到患部的凹陷位置即可. 只是脂肪注入後的自體吸收程度常因不同部位的活動型態而有極大落差, 日後也可能因此需做第二次的補脂手術始可達到滿意的結果。

除了上述修補身體表面的缺陷外, 自體脂肪也可以運用在改善或強化身體曲線等單純的美容用途上, 例如豐臀, 胸肌塑形, 修飾肌肉紋理(如雞爪手, 膝蓋或小腿肚曲線), 或是與超音波溶脂結合來雕塑六塊肌線條, 甚至是前次抽脂不當產生的皮膚凹陷修補等, 臨床上的運用極為廣泛且具有彈性, 患者可與醫師充分討論後再做選擇與決定。